使用 RNA 测序对细胞类型进行分类

RNA 测序 (RNA-seq) 是一项革命性技术，改变了基因组学领域。它为研究人员揭示细胞和分子水平上发生的许多复杂过程开辟了新途径。与 DNA 测序不同，RNA-seq 通过提供任何给定时间所有活性基因的快照来深入了解基因组的功能元件。那么，这如何帮助用户对不同的细胞类型进行分类呢？请继续阅读以了解更多信息。

RNA 测序在细胞类型分类中的威力

RNA 测序已成为细胞类型分类的强大工具。它使科学家能够识别特定的细胞类型并了解它们在各种生物过程中的作用。这是因为 RNA-seq 能够分析单个细胞中的基因表达水平。许多研究领域都将从这种开创性的方法中受益，但它在研究肺纤维化等疾病方面已经显示出非凡的潜力，在这些疾病中，不同细胞群的作用尚未全了解。

单细胞 RNA 测序：游戏规则改变者

单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 将 RNA 测序提升到一个新水平。它使科学家能够分析单个细胞的转录组，提供细胞类型和状态的高分辨率视图。与传统的 RNA 测序方法相比，这是一个重大进步，传统的 RNA 测序方法提供大量细胞的平均基因表达谱。

在最近一项题为“单细胞 RNA 测序揭示肺纤维化中不同上皮和间质谱系的促纤维化作用”的研究中，scRNA-seq 被用来揭示肺纤维化的复杂细胞景观。该研究使用 10x Genomics Chromium 平台进行单细胞 RNA 测序，该平台生成乳液中的单细胞凝胶珠 (GEM)，用于逆转录过程以创建 cDNA。然后对该 cDNA 进行扩增并用于测序。

DeNovix 在 RNA 测序中的作用

DeNovix DS-11 FX+ 分光光度计/荧光计在这项研究中发挥了至关重要的作用。该仪器用于定量 RNA，这是 RNA 测序过程中的关键步骤。RNA的定量确保了测序过程有足够的材料，并有助于保证样品的质量。这是 10x Genomics 平台单细胞 RNA 测序的准备步骤。

细胞计数是 RNA 测序的另一个重要准备步骤。在一项相关研究“模拟人类肺细胞暴露于野火中发现异常的 lncRNA 特征”中，DeNovix CellDrop™ 系统用于在 0.4% 台盼蓝 1:1 稀释液中对人类永生化支气管气管细胞 (AALE) 进行计数，并在其死亡前 24 小时进行计数。直接烟雾暴露（DSE）。暴露于气液界面 (ALI) 室后，细胞用于 RNA 测序分析，以识别 IncRNA 的变化。结果表明烟雾成分对于野火烟雾的分子效应的重要性。具体来说： 

“我们的结果阐明了化学成分（以及地理来源）在评估野火烟雾暴露可能导致的呼吸系统健康风险方面的重要性。我们使用通过实验生成的 RNA-seq 数据进行公正的分析，旨在识别差异表达的转录本，在这里，通过严格和全局的分析，我们证明不同的野火烟雾会诱导 lncRNA 的异常表达。”

机器学习和 RNA 测序

机器学习是另一种越来越多地与 RNA 测序结合使用的工具。通过训练已知细胞类型的数据，机器学习算法可以根据细胞类型的基因表达谱对细胞类型进行分类。这可以大大提高细胞类型分类的准确性和效率。

RNA测序的应用

RNA-seq 的应用广泛且多样。从了解疾病中细胞群的复杂性到发现选择性剪接变体，RNA-seq 是现代基因组学库中的多功能工具。

RNA 测序的未来

随着新技术和方法的不断开发，RNA测序的未来是光明的。对不同 RNA 分子及其表达水平的研究不断增长，这将与 RNA-seq 的进步契合，并扩大我们可以理解的细胞类型的数量。 

在 DeNovix，我们很自豪能够成为这个令人兴奋的领域的一部分。我们邀请您探索我们的产品和服务范围，并与我们一起突破 RNA 测序的可能界限。使用我们的组合分光光度计/荧光计和开创性的自动细胞计数器，用户可以优化 RNA 测序的准备步骤，以保证最高的质量。我们可以一起继续解开细胞的秘密，并在分子水平上增进我们对生命的理解。